Если вы не собираетесь продвать ссылки на своем сайте - пузомерка ни на что не влияет. Никакой связи между тИЦ и позициями/посещаемостью сайта на сегодня НЕТ. Так же и с PR в Google.
всплывающая реклама и прочие попапы сейчас вообще крайне противопоказаны для нормального сайта. особенно после недавнего официального заявления от Яндекса лучше не играть с огнем