Я понял что мне необходимо сделать без выключения позиций - единственное прошу помощи - где поковыряться в импорте YML файла для яндекса чтобы при выгрузке позиции с количеством "-1" статус available ставился false, а не true, (из-за этого под заказ для маркета пришлось переделать товар с количеством "0" который и ставит false как просит маркет - если так сделаю, то все поставлю на свои места и не буду выгружать позиции с "0" и будет счастье)
Маркет просит:
available="false" — товар на заказ.
available="true" — товар в наличии.